大学教授·大(da)岛健(jian)藏(久松信(xin)美(mei)饰)在(zai)东京都内的巷(xiang)子(zi)里被不明身份(fen)的人(ren)刺杀(sha)，警视(shi)厅搜查一(yi)课·十津(jin)川警官(高桥英树(shu)饰)和龟井刑警(高田(tian)纯次饰(shi))则亲临现场。根(gen)据第一发(fa)现者(zhe)，被(bei)害者是“十津川…”说完(wan)就断气了(le)。大(da)岛是有名的“线(xian)粒体学(xue)”第一人，但十津(jin)川却素不相识…。十津川一边困惑一边开始搜查(cha)，在现场附近的(de)监(jian)控录像中发(fa)现(xian)了可疑男子(zi)的身影(ying)。
　　为(wei)了寻找线索，十津(jin)川等人询问了副教授(shou)早(zao)濑由美(黑谷友香饰(shi))和支(zhi)援(yuan)研究(jiu)的生物相(xiang)关公司社长中园宏司(中村俊介饰(shi))，得知了(le)令(ling)人震惊(jing)的事实。监控录像中的男(nan)子，一定是两(liang)人的青梅竹(zhu)马·赤(chi)池庄(zhuang)五郎(松尾谕饰)。由(you)美、中园、赤池3人是北海道(dao)·新十津川(chuan)町(ding)出(chu)身，3人(ren)发誓永远的友(you)情，但由美和(he)中(zhong)园以大学(xue)升学为契(qi)机来到东京。据说只(zhi)有赤池留在当地(di)继(ji)承了农业。赤是认真地进(jin)行(hang)品种(zhong)改良,因此详细大岛(dao)由美在(zai)农作物教授介绍了的,但大岛是(shi)品(pin)种(zhong)改良的为了咨询经常(chang)来访赤(chi)为了整肃(su)“不久的家伙”,他(ta)的(de)努力“小学生的“自(zi)由研究水平(ping)和部落。大岛教授在临死(si)前(qian)留下的(de)话=“十津川(chuan)”是指赤池吗(ma)?!?
　　之后，为(wei)了追寻逃往(wang)故乡的赤池的踪迹，十津川和(he)龟井也前往新十津川町。可(ke)是，赤池竟(jing)然拿(na)着猎枪闯入了(le)街道事务所，把(ba)街道的资产家浦野典史(shi)(萤(ying)火虫(chong)雪次朗)等人作为人质关在(zai)那里(li)。这时由美想阻止好友暴走，十津川为了保护她，把枪口对准了赤池…!赤池对对峙的十(shi)津川说:“撤销札沼线的(de)废止!”赤池(chi)的真正用意是……!?紧(jin)接着，在遥远的东(dong)京(jing)，又发生(sheng)了一(yi)起悲剧……!?