西(xi)元2199年，来自太阳系外的敌人加米拉(la)斯(si)帝(di)国，为了挽(wan)救母星的危亡，开(kai)始侵略(lue)其他星球。地球(qiu)军(jun1)在与加米拉斯帝国军的交战(zhan)中(zhong)惨败(bai)，同(tong)时加米拉斯帝(di)国军向地球发射(she)大量含有(you)放(fang)射能(neng)的游星炸弹(dan)。地(di)球的抵抗力量(liang)越来(lai)越(yue)弱。本与加米拉斯为双子星球的伊(yi)斯坎(kan)达尔星(xing)球仗义相助，向地(di)球发送了波动引(yin)擎和波动(dong)炮的设计图(tu)纸，并告知地球(qiu)军本(ben)星球拥有清除放射能的设备“宇宙清洗器D”。在(zai)与欧洲、美洲失去(qu)联系的情况(kuang)下，地球(qiu)防(fang)卫(wei)军利用(yong)伊斯坎达尔星球提供的技术将沉睡于海(hai)底的大和号(hao)改造为宇宙战舰。大(da)和号(hao)全体乘员踏(ta)上(shang)了(le)取回“宇(yu)宙清洗(xi)器D”的漫漫征程。