故事发生在1999年，那个不详的世纪之末。坐落在深山之中，由(you)于不断的(de)发生灵异事(shi)件而(er)被称为“超自然(ran)学(xue)院”的(de)私立学校里(li)，迎(ying)来(lai)了(le)它年轻强势(shi)的新一任校长——神代玛雅（日笠阳子 配音）。绝对不相信有超自(zi)然力量(liang)存在的(de)玛雅，此行便是为了调查父亲(qin)里奇的死因而来，这样的她，遇见了一位名叫内田文明（水岛大宙(zhou) 配音）的(de)神秘男子，刚刚登场的内(nei)田，便说(shuo)出了(le)让玛(ma)雅(ya)吃惊(jing)的话语，他居然(ran)来自未(wei)来的2012年(nian)！
　　这个形迹(ji)可疑的男(nan)子的话能够相信吗？2012年的世界是(shi)怎样(yang)的(de)景(jing)象？一连串意(yi)外(wai)让玛(ma)雅(ya)逐(zhu)渐(jian)相信了内田的(de)说辞(ci)，而内田究竟为(wei)何而回到(dao)过去(qu)，这原因也渐渐的浮出了水面。